Som i de tidligere Prison Tycoon-spill er det din oppgave å drive et fengsel, hvor du skal sørge for at de ansatte er fornøyde og ikke blir overfalt, og samtidig sikre at fangene holder seg bak murene. Spillet er lagt opp slik at du starter i det små med å bygge et lite fengsel, som du gradvis kan utvide for å få plass til flere fanger. I Prison Tycoon 3- Lockdown er du leder for et privat fengsel fylt med hardbarkede forbrytere.